在生命的奇妙旅程中,遺傳信息的準確傳遞和維持至關重要。而 DNA 聚合酶,作為一類在 DNA 合成過程中起著核心作用的酶,無疑是這場生命接力賽中的關鍵 “選手"。
科學家 Arthur Kornberg 從大腸桿菌中成功分離并深入研究出第一種 DNA 聚合酶,后來它被命名為 DNA 聚合酶 I。這是一種由一條多肽鏈組成的單鏈酶,它的發(fā)現(xiàn)為后續(xù)對 DNA 聚合酶家族的探索拉開了序幕。隨著研究的不斷深入,科學家們又陸續(xù)在大腸桿菌中發(fā)現(xiàn)了另外 4 種不同的 DNA 聚合酶,它們共同構(gòu)成了一個緊密協(xié)作的 “團隊",在 DNA 復制和修復等重要過程中各司其職。
DNA 聚合酶的主要使命之一是在細胞分裂時,精確地復制原有的 DNA,從而確保遺傳信息能夠絲毫不差地傳遞給下一代細胞。在這個過程中,DNA 聚合酶如同精密的 “工匠",它們成對工作,同時對 DNA 的兩條鏈進行復制。具體來說,DNA 聚合酶會在新生 DNA 鏈的 3′ - OH 端添加脫氧核苷酸,按照堿基互補配對原則,腺嘌呤(A)與胸腺嘧啶(T)配對,鳥嘌呤(G)與胞嘧啶(C)配對,使得 DNA 鏈以 5′→3′的方向不斷延伸。不過,DNA 聚合酶自身無法啟動復制的 “開關",需要有引物的存在,它才能開始添加核苷酸的工作。在原核生物中,DNA 聚合酶 III 擔當起主要負責復制的重任;而在真核生物里,DNA 聚合酶 δ 則是復制工作的 “主力軍"。另外,DNA 聚合酶 I 也發(fā)揮著重要的輔助作用,它通過 5′→3′外切酶活性去除滯后鏈上的 RNA 引物,并利用聚合酶活性填補引物移除后留下的空隙。

DNA 復制是一個復雜且龐大的工程,維持基因組的完整性不容有失。除了復制過程中可能出現(xiàn)的錯誤,外界環(huán)境等因素也會導致 DNA 損傷,因此 DNA 修復是一個持續(xù)不停的過程。DNA 聚合酶在其中扮演著關鍵角色,通過一系列的機制來修正這些錯誤和損傷。

DNA 復制雖然是一個高度精確的過程,大約每加入 10?到 10?個核苷酸就可能發(fā)生一次錯誤。如果這些錯誤得不到糾正,不正確的堿基配對可能會嚴重影響蛋白質(zhì)的正常功能,甚至可能引發(fā)癌癥等嚴重后果。此時,DNA 聚合酶的外切酶活性就發(fā)揮了重要作用。它能夠向后移動一步,通過 3′→5′外切酶活性將錯配的堿基移除,這個過程就叫做校對。此外,DNA 聚合酶還參與復制后修復過程以及跨損傷合成過程。在跨損傷合成過程中,即使面對未修復的 DNA 損傷區(qū)域,DNA 聚合酶也能 “想辦法" 跨越過去,使復制得以繼續(xù)進行。

在原核生物的典型代表 —— 大腸桿菌中,科學家們發(fā)現(xiàn)了五種不同的 DNA 聚合酶,它們在結(jié)構(gòu)、功能、聚合速率和延展性等方面都有所不同。
DNA 聚合酶 I:由 polA 基因編碼,是由一條多肽鏈構(gòu)成的單體酶。它主要參與 DNA 的重組與修復工作,具備 5'→3' 和 3'→5' 兩個方向的外切酶活性。在 DNA 復制過程中,它利用 5'→3' 外切酶活性從滯后鏈中去除 RNA 引物,然后憑借聚合酶功能填補產(chǎn)生的空隙。
DNA 聚合酶 II:由 polB 基因編碼,由七個亞基構(gòu)成。它的主要職責是進行 DNA 修復,同時也作為 DNA 聚合酶 III 的 “候補隊員"。它具有 3'→5' 外切酶活性,具備一定的校對能力,能夠在 DNA 修復過程中糾正一些錯誤。
DNA 聚合酶 III:這是大腸桿菌中主要執(zhí)行 DNA 復制任務的 “核心成員",由 polC 基因編碼。它具有最高的聚合速率與延展性,能高效地完成 DNA 復制工作。同時,它也具備 3'→5' 的校對功能,確保復制的準確性。它由 13 個亞基組成,包含 9 種不同類型的亞基,其中兩個核心結(jié)構(gòu)域各由 α(執(zhí)行聚合酶功能)、ε(3'→5' 外切酶)和 θ 亞基構(gòu)成。此外,它還與一個由 τ?γδδ’構(gòu)成的裝夾復合體相連,χ 與 ψ 兩個亞基也附著于其中。β 亞基以二聚體的形式形成兩個滑動夾環(huán),顯著增強聚合酶的延展性,使其在復制過程中不會輕易脫離 DNA 模板。
DNA 聚合酶 IV:由 dinB 基因編碼,當細胞遭遇 DNA 損傷、復制被阻斷時,它會啟動 SOS 修復反應,負責進行跨損傷合成,以繞過 DNA 模板中的損傷區(qū)域繼續(xù)合成 DNA。
DNA 聚合酶 V:由一個 UmuC 單體和一個 UmuD 二聚體構(gòu)成,同樣在 SOS 反應期間發(fā)揮重要作用,參與受損 DNA 的容錯性復制和修復。
與原核生物類似,真核細胞也擁有多種 DNA 聚合酶,它們分別執(zhí)行著不同的功能,比如線粒體 DNA 復制、核 DNA 復制等。在核 DNA 復制中,主要由 DNA 聚合酶 δ 和 α 完成。目前在人類中已鑒定出至少 15 種 DNA 聚合酶,以下是幾種常見且重要的 DNA 聚合酶:
DNA 聚合酶 δ:作為真核生物中主要的 DNA 復制酶,它具有 3'→5' 外切酶活性,可用于校對,確保 DNA 復制的準確性,對維持真核生物基因組的結(jié)構(gòu)完整性和遺傳穩(wěn)定性具有重要作用2。
DNA 聚合酶 α:其主要功能是合成引物。它的小亞基具有引物酶活性,而大亞基具有聚合酶活性。在 DNA 復制過程中,它為岡崎片段合成引物,然后由 DNA 聚合酶 δ 接著延長引物,完成 DNA 的復制。
DNA 聚合酶 θ:主要功能是進行 DNA 修復,并在滯后鏈上移除岡崎片段的引物,為 DNA 的準確復制和修復提供保障。
DNA 聚合酶 γ:是真核生物中線粒體 DNA 的主要復制酶,負責線粒體 DNA 的復制工作,保障線粒體遺傳信息的穩(wěn)定傳遞。

EG20101S - 抗體法熱啟動 Taq DNA 聚合酶是一種經(jīng)過特殊修飾的 DNA 聚合酶。它使用單克隆抗體進行修飾,在 55℃以下時,抗體可以有效地封閉 DNA 聚合酶的活性,就像給酶 “戴上了枷鎖",使其無法隨意工作。而當溫度升高到一定程度,抗體與酶發(fā)生不可逆解離,聚合酶就會恢復活性,“枷鎖" 被解開,開始正常工作。這種特性使得它能夠有效避免低溫下的非特異性擴增,大大提高了 PCR 等實驗的準確性和可靠性。
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